この頃から論議されるようになった学校週５日制の実施については、平成１１（１９９９）年３月の文部省通知で平成１４（２００２）年４月１日からすべての土曜日を休業日とする完全学校週５日制が実施されていくが、安城学園では安城学園高等学校が県下の他校に先駆け、平成４（１９９２）年４月に導入、岡崎城西高等学校も平成９（１９９７）年に移行した。学園の高等学校において続く課題は男女共学化であった。これが平成１１（１９９９）年４月、女子校の安城学園高等学校、男子校の岡崎城西高等学校ともに男女共学制に踏み切ったのだった。
　共学への移行準備は、平成１０（１９９８）年に始まった。共学校見学に始まり、共学化に伴う施設設備―保健室・更衣室・トイレなどの拡張・改修、制服制定、学校案内作成、広報活動などこまごまとした準備が進められた。
　応募状況が気にかかった。しかし、幸い大きな問題はなかった。
　安城学園高等学校では、入学生徒６７７名のうち、男子生徒は８９名、全体の１３％だった。１組から８組までを共学クラス、９組から１７組までを女子クラスに編成された。

「明るく元気な本学園の良さを、男女共学を一つのばねにして更に発展させ、活力に満ちた学園生活を実現していってもらいたいと期待を大きくしています。学校の施設・設備も男女共学にともなって大きく変わります。すでに体育館は全面改装されて明るく使いやすくなっておりますし、昨年から工事中であった南館も最後の仕上げ工事に入っており完成間近です。１年生の皆さんが待望の新館に移るのももうすぐです。」

　時の校長・三浦定夫は学園報『彩雲』６３号に、「順調にスタート・活気あふれる日々」といった感触を述べたのだった。
　岡崎城西高等学校でも、安城学園高等学校とは事情を異にしたが、男女共学に伴う変化は大きかった。
　平成１１（１９９９）年２月、新入生選抜試験を実施したが、８９３名もの女子が受験し、共学の順調なスタートを予測させた。４月７日、共学最初の入学式を挙行した。女子生徒は１５２名、新入生の２３％という率であった。「進学を目標とした女子生徒を２割確保する」という目標どおりだった。基準を男子より高く設定したので女子生徒には優秀な者が多く、新入生宣誓は女子が代表して行った。